昆明市儿童医院前兴院区，位于南市区前兴路288号，需要到前兴院区就诊的患者可乘坐3路、24路、63路、78路、99路、122路、127路、129路、166路、185路、196路、197路、199路、A2路到前兴路公交枢纽站或大庄村站下车前往就诊。

昆明市儿童医院书林院区，位于书林街28号，需要到书林院区就诊的患儿可乘坐107路，213路，3路，4路，62路，62路空调车，62路区间调头，73路，90路，98路，A1路，K12路特色公交107路快线，206路，到金马坊站下车即可。